Sus inicios datan del año 1877 albergando documentos de las Comisiones Geográfica Exploradora y Geodésica Mexicana, así como la colección privada de Manuel Orozco y Berra. En 1977 se sumó la colección del IPGH compuesta por 58 mil cartas.

La mapoteca no sólo está integrada por cartas geográficas, incluye también un gran catálogo de fotografías aéreas e instrumentos de gran valor histórico y académico, como teodolitos, sextantes, brújulas y horizontes artificiales así como un valioso archivo técnico compuesto por más de cinco mil expedientes y libretas de campo escritos entre 1860 y 1970.

Una interesante colección de fotografías de la Comisión de Límites de México y Guatemala, producto de la observación de la zona fronteriza, se conserva en el lugar junto con la colección de mapas trazados por ese equipo.

Entre colecciones, cartas de meteorología, archivos general y técnico, atlas, fotografías, libros y mapas digitalizados, entre otros, el acervo alberga aproximadamente 150 mil documentos.

Este generoso legado se encuentra disponible para consulta del público en general de manera gratuita en el recinto que comparte con el IPGH.