Son los órganos encargados de promover, coordinar y difundir el desarrollo científico y técnico de sus respectivos campos de acción en los Estados Miembros, a través de los programas del IPGH.
En la ejecución de sus labores, las Comisiones son apoyadas por la Secretaría General y las Secciones Nacionales.
Las Comisiones del IPGH son:
- Comisión de Cartografía;
- Comisión de Geografía;
- Comisión de Historia; y
- Comisión de Geofísica.
Para el periodo de su gestión, cada Comisión establece los Comités y Grupos de Trabajo necesarios para el desarrollo de la estrategia científica, la cual es definida por la Asamblea General, a través de un trabajo conjunto y coordinado con las propuestas de los especialistas.